Образован определением Священного Синода Русской Православной Церкви 16 июля 1993 года при Воскресенском соборе на Нижней Дебре в Костроме.
Воскресенский собор с приделами во имя Трех святителей и святой великомученицы Екатерины, воздвигнутый в 1645 году попечением купца Кирилла Исакова и расписанный в 1652 году артелью костромских изографов под руководством Василия Запокровского и Гурия Никитина, является одним из красивейших храмов Костромы. По преданию, средства на его постройку были получены необычным образом. Кирилл Исаков, входивший в состав московской Гостиной сотни, вел торговлю кожами и закупал в Англии краски, которые доставлялись по морю в бочонках. В одном из таких бочонков, прибывшем к купцу, вместо красок оказалось золото. Исаков хотел возвратить его англичанам, но те распорядились употребить золото на какое-нибудь благое дело; тогда купец пожертвовал эти средства на возведение каменного храма в Костроме, на своей родине.
Знаменский храм, стоящий к югу от Воскресенского собора, был построен вскоре после него и использовался как «теплая» (зимняя) церковь. Первоначально этот храм именовался Георгиевским, но после перестройки в 1799-1802 годах был освящен в честь иконы Пресвятой Богородицы «Знамение»; он имел приделы во имя святых мучеников Космы и Дамиана и блаженного Прокопия Устюжского.
В начале тридцатых годов ХХ века Знаменский и Воскресенский храмы были закрыты. Воскресенский храм в 1946 году возвратили верующим, а Знаменский подвергся существенному разрушению: его многоярусную колокольню уничтожили до основания, в самом церковном здании разместилась котельная. В 1964-1991 году Воскресенский храм являлся кафедральным собором Костромской епархии, здесь пребывала чудотворная Феодоровская икона Божией Матери; с 1991 года он вновь стал приходским храмом, но сохранил соборный статус.
В число насельниц Знаменской обители вошли монахини и послушницы, обслуживающие Воскресенский собор и резиденцию управляющего Костромской епархией. Для размещения сестер городской администрацией было передано здание бывшего детского сада по улице Осыпной. С 1997 года при монастыре действует медицинский центр во имя преподобномученицы великой княгини Елисаветы Феодоровны, включающий в свой состав стоматологический и офтальмологический кабинеты, отделение для стационарного лечения. При обители имеется небольшая богадельня.
В 2001 году начались работы по восстановлению Знаменского храма; его колокольня, полностью воссозданная на средства благотворителей, была освящена 26 сентября 2001 года. Освящение самого Знаменского храма совершил 8 августа 2009 года архиепископ Костромской и Галичский Александр.
Святыни монастыря:
— чтимый список с чудотворной Феодоровской иконы Божией Матери;
— чтимый список с чудотворной иконы святителя Николая из Николо-Бабаевского мужского монастыря;
— ковчег с частицами мощей Киево-Печерских святых.
Праздники:
30 января / 12 февраля – Собор вселенских учителей и святителей Василия Великого, Григория Богослова и Иоанна Златоустого; 13/26 сентября – память обновления (освящения) храма Воскресения Христова в Иерусалиме (Воскресение словущее); 24 ноября / 7 декабря – великомученицы Екатерины; 27 ноября / 10 декабря – иконы Божией Матери «Знамение».
Справочная информация:
Адрес: 156005, г. Кострома, ул. Кооперации (Нижняя Дебря), 37. Тел.: (4942) 54-77-52.
Проезд (по г. Костроме): троллейбусы №№ 1, 4, автобусы №№ 20, 21, 25, 26 до остановки «Улица Подлипаева»; троллейбусы № 2, 3, 7, автобусы № 1, 2, 9, 14 до остановки «Универмаг «Кострома»».
